Лекарственным сырьем у него в равной степени служат и плоды, и корень. Щавель оказывает вяжущие или слабительные свойства, которые наступают через 10-12 часов, определяются исключительно дозировкой приема. В качестве слабительного на ночь принимают до 1г на приём, а противопоносный эффект будет при приеме 0,25г трижды в день.

Вещества, которые входят в состав конского щавеля, помогают снять спазм, а также снижают выраженность воспалительного процесса в кишечнике. Наиболее частое применение семян — это лечение поносов. В том числе дизентерийных. Чаще всего 10г на 100мл воды. Пить по столовой ложке 3-4 раза в день.

Для конского щавля также характерно желчегонное, противозудное, противоглистное, кровоостанавливающее и противовоспалительное действие. Его назначают при запорах, возникших на фоне воспаления толстого кишечника, геморрое, трещинах прямой кишки. Наружно назначается для лечения экземы, для ускорения заживления гнойных ран, фурункулов.

Отвар из семян (1:10) используют для лечения ожогов и пролежней в виде компрессов.

Осторожно применять при болезнях почек и пациентам с остеопорозом, поскольку при длительном приеме он может вымывать кальций из костей.